Listamos nesta página alguns dos projetos em execução
Montagem do sequenciamento Illumina de 2 biótipos fdo ungo Moniliophthora Perniciosa, predição de genes e protéinas, e anotação funcional dos mesmos.
A citricultura é uma atividade produtiva que representa elevada importância socioeconômica, tanto a nível nacional quanto internacional, sobressaindo-se principalmente com a produção de laranjas e de sucos. Porém, essa atividade tem sido altamente afetada por patógenos, o que implica negativamente nos níveis de produtividade, resultando em menores lucros para os produtores. Apesar da grande diversidade de estratégias que os patógenos utilizam para infectar seus hospedeiros, nota-se na natureza que as doenças são exceções, enquanto a resistência é uma regra, e isso acontece graças ao eficiente mecanismo de defesa das plantas. Diante disso, o objetivo deste trabalho é identificar e caracterizar in silico receptores PRRs presentes em genomas de Citrus spp. quanto aos seus aspectos evolutivos e funcionais e verificar o potencial e variabilidade de resistência entre as espécies in vivo. Inicialmente, será realizada uma parte do trabalho in silico, utilizando dados de entrada dos seis genomas de Citrus sp. e um de Poncirus, sendo feita a anotação dos seus domínios e posterior identificação e classificação das PRRs. Serão realizados ainda, os alinhamentos e análises filogenéticas; análise de duplicação de genes; identificação dos clusters gênicos e desenvolvimento dos marcadores. Posteriormente, in vitro, os clusters serão identificados, isolados e sequenciados, sendo finalmente analisados os resultados provenientes dos dados de sequenciamento e feita as correlações fenotípicas com genótipos considerados como padrões de resistência e suscetibilidade, esses oriundos de germoplasmas de citrus jà caracterizados. Almejando-se compreender a dinâmica desse sistema imune, gerando então importantes perspectivas para o melhoramento das espécies cítricas.